Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SarnpQ9D1J3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SarnpQ9D1J3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SarnpQ9D1J3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms