Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MceeQ9D1I5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MceeQ9D1I5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MceeQ9D1I5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MceeQ9D1I5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms