Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lmbr1lQ9D1E5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbr1lQ9D1E5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmbr1lQ9D1E5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmbr1lQ9D1E5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms