Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cthrc1Q9D1D6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cthrc1Q9D1D6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cthrc1Q9D1D6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cthrc1Q9D1D6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms