Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Syf2Q9D198 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syf2Q9D198 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syf2Q9D198 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syf2Q9D198 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syf2Q9D198 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms