Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Susd3Q9D176 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Susd3Q9D176 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd3Q9D176 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Susd3Q9D176 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Susd3Q9D176 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms