Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D131 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D131 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D131 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D131 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D131 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D131 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D131 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D131 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D131 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D131 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D131 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D131 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D131 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D131 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D131 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D131 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D131 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D131 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D131 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D131 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D131 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D131 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D131 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D131 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D131 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D131 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q9D131 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q9D131 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D131 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D131 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D131 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D131 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D131 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D131 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q9D131 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D131 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D131 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D131 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D131 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D131 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D131 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D131 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D131 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D131 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D131 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D131 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9D131 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D131 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D131 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D131 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D131 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D131 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D131 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D131 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D131 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D131 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D131 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D131 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D131 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D131 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D131 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D131 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D131 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D131 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D131 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D131 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D131 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D131 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D131 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D131 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D131 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D131 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D131 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D131 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D131 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D131 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D131 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D131 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D131 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D131 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D131 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D131 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D131 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D131 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9D131 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms