Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20,89■□□□□ 0,94
Ift27Q9D0P8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20,85■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Ift27Q9D0P8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,81■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,8■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20,78■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Ift27Q9D0P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Ift27Q9D0P8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Ift27Q9D0P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Ift27Q9D0P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,9 ms