Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm6Q9CZ69 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm6Q9CZ69 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cmtm6Q9CZ69 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm6Q9CZ69 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm6Q9CZ69 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cmtm6Q9CZ69 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cmtm6Q9CZ69 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cmtm6Q9CZ69 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm6Q9CZ69 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmtm6Q9CZ69 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms