Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Q9CYI0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q9CYI0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Q9CYI0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Q9CYI0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9CYI0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Q9CYI0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9CYI0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Q9CYI0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9CYI0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9CYI0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9CYI0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Q9CYI0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9CYI0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9CYI0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Q9CYI0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms