Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ssu72Q9CY97 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ssu72Q9CY97 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ssu72Q9CY97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ssu72Q9CY97 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ssu72Q9CY97 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms