Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mis12Q9CY25 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mis12Q9CY25 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mis12Q9CY25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mis12Q9CY25 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mis12Q9CY25 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mis12Q9CY25 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mis12Q9CY25 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mis12Q9CY25 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mis12Q9CY25 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mis12Q9CY25 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms