Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx7Q9CY18 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx7Q9CY18 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx7Q9CY18 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snx7Q9CY18 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms