Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PmpcbQ9CXT8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PmpcbQ9CXT8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PmpcbQ9CXT8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PmpcbQ9CXT8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PmpcbQ9CXT8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms