Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpusd4Q9CWX4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rpusd4Q9CWX4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd4Q9CWX4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd4Q9CWX4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms