Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cxxc1Q9CWW7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxxc1Q9CWW7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxxc1Q9CWW7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxxc1Q9CWW7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms