Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb2bQ9CWF2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb2bQ9CWF2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb2bQ9CWF2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tubb2bQ9CWF2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tubb2bQ9CWF2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms