Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930553M12RikQ9CUH1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930553M12RikQ9CUH1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms