Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Otud1Q9CUB6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Otud1Q9CUB6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Otud1Q9CUB6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud1Q9CUB6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms