Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lhfpl3Q9CTN8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms