Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snw1Q9CSN1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snw1Q9CSN1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Snw1Q9CSN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snw1Q9CSN1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snw1Q9CSN1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms