Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
FanclQ9CR14 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
FanclQ9CR14 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28,33■■■□□ 2,13
FanclQ9CR14 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
FanclQ9CR14 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
FanclQ9CR14 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
FanclQ9CR14 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
FanclQ9CR14 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28,29■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
FanclQ9CR14 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,22■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,2■■■□□ 2,11
FanclQ9CR14 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28,14■■■□□ 2,1
FanclQ9CR14 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28,13■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28,12■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28,1■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28,08■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
FanclQ9CR14 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,04■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
FanclQ9CR14 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
FanclQ9CR14 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
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