Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc2Q9CQP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc2Q9CQP2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trappc2Q9CQP2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trappc2Q9CQP2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms