Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RTRAFQ9CQE8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RTRAFQ9CQE8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RTRAFQ9CQE8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms