Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sar1bQ9CQC9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sar1bQ9CQC9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sar1bQ9CQC9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sar1bQ9CQC9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms