Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpa3Q9CQ71 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpa3Q9CQ71 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpa3Q9CQ71 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpa3Q9CQ71 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpa3Q9CQ71 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpa3Q9CQ71 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms