Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ncbp2Q9CQ49 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ncbp2Q9CQ49 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ncbp2Q9CQ49 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ncbp2Q9CQ49 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ncbp2Q9CQ49 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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