Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Chmp3Q9CQ10 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp3Q9CQ10 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp3Q9CQ10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp3Q9CQ10 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp3Q9CQ10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp3Q9CQ10 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms