Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cep41Q99NF3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cep41Q99NF3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep41Q99NF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cep41Q99NF3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms