Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atoh8Q99NA2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atoh8Q99NA2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atoh8Q99NA2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atoh8Q99NA2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atoh8Q99NA2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms