Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pramel1Q99MW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pramel1Q99MW3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramel1Q99MW3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pramel1Q99MW3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pramel1Q99MW3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms