Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpgs1Q99MS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tpgs1Q99MS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpgs1Q99MS8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpgs1Q99MS8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpgs1Q99MS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms