Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Atp1b4Q99ME6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Atp1b4Q99ME6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Atp1b4Q99ME6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Atp1b4Q99ME6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Atp1b4Q99ME6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atp1b4Q99ME6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atp1b4Q99ME6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms