Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cttnbp2nlQ99LJ0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms