Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp16Q99LG0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Usp16Q99LG0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Usp16Q99LG0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Usp16Q99LG0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Usp16Q99LG0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp16Q99LG0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp16Q99LG0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms