Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmp1Q99KU0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmp1Q99KU0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmp1Q99KU0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmp1Q99KU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmp1Q99KU0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmp1Q99KU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms