Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prss28Q924N9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prss28Q924N9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prss28Q924N9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prss28Q924N9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prss28Q924N9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prss28Q924N9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prss28Q924N9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prss28Q924N9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms