Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Traf7Q922B6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Traf7Q922B6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Traf7Q922B6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Traf7Q922B6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Traf7Q922B6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Traf7Q922B6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms