Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Med28Q920D3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Med28Q920D3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Med28Q920D3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Med28Q920D3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms