Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Afg3l1Q920A7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l1Q920A7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l1Q920A7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Afg3l1Q920A7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Afg3l1Q920A7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Afg3l1Q920A7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Afg3l1Q920A7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Afg3l1Q920A7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.9 ms