Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Smarca5Q91ZW3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Smarca5Q91ZW3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca5Q91ZW3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Smarca5Q91ZW3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca5Q91ZW3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms