Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ7

Pcdhb3, Protocadherin beta 3, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb3Q91XZ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdhb3Q91XZ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdhb3Q91XZ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb3Q91XZ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb3Q91XZ7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdhb3Q91XZ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb3Q91XZ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms