Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE11

Mtmr6, Myotubularin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr6Q8VE11 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mtmr6Q8VE11 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mtmr6Q8VE11 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mtmr6Q8VE11 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mtmr6Q8VE11 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms