Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc39cQ8VE09 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc39cQ8VE09 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc39cQ8VE09 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc39cQ8VE09 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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