Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rab3il1Q8VDV3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rab3il1Q8VDV3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab3il1Q8VDV3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rab3il1Q8VDV3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rab3il1Q8VDV3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms