Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam20bQ8VCS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam20bQ8VCS3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam20bQ8VCS3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam20bQ8VCS3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms