Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmprss4Q8VCA5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss4Q8VCA5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmprss4Q8VCA5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmprss4Q8VCA5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmprss4Q8VCA5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss4Q8VCA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss4Q8VCA5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmprss4Q8VCA5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmprss4Q8VCA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss4Q8VCA5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss4Q8VCA5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss4Q8VCA5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss4Q8VCA5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss4Q8VCA5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss4Q8VCA5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss4Q8VCA5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss4Q8VCA5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.2 ms