Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TxlnbQ8VBT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TxlnbQ8VBT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TxlnbQ8VBT1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TxlnbQ8VBT1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TxlnbQ8VBT1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms