Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk8Q8R3L8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk8Q8R3L8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk8Q8R3L8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cdk8Q8R3L8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cdk8Q8R3L8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms