Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim29Q8R2Q0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim29Q8R2Q0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim29Q8R2Q0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim29Q8R2Q0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms